步进电机驱动器能用于多种不同的应用。设计工程师在设计中使用步进电机驱动器时面对一些共通的挑战。首先，当今的大多数设计都要求步进电机驱动应用及相关步进电机驱动元件提供低能耗和高能效。例如，在如果风扇驱动器电路板位于密封壳体内部，就会产生热量，要求额外的能耗来将它冷却。因此，就需要使用内置风扇在内部环流冷风，以减少热量并管理散热。故工程师可能会要求低功率损耗，同时还要求强大、具备高能效冷却功能的电机。
其次，从终端用户角度来讲，极需要降低步进电机产生的噪声，以避免造成不适的感觉。设计人员还必须能够补偿系统中的任何外部噪声或振动。再次，无论是因为居住空间有限或是用户偏好，消费者对紧凑型方案的需求高是一项普通的消费趋势。这趋势导致更小尺寸及低噪声的步进电机更受偏好，但这在尝试补偿其它设计要求时并不总是具有可能性。
值得注意的是，由于要求高压电源来驱动白家电及工业等应用，步进电机及步进电机驱动器的耐用性及安全性至关重要。更不用说工程师需要选择能够精确控制速度的可靠步进电机。